军事方面，孙策以大将军开府治事，内设军师处，以郭嘉为军师祭酒，下统军师、参军数十名，参谋军事。外设九都督：周瑜督江陵，黄忠督南阳，鲁肃督洛阳，吕范督浚仪，纪灵督任城，徐琨督济南，沈友督北海，太史慈督辽东，甘宁督水师，各委派军师一人、参军数人辅佐军事。此外再设长史一人，由杨修担任，代表孙策入朝主政，与天子斗智斗勇。
军师府和九都督直接向孙策本人负责，不受州郡限制。军权是立身之本，任何时候都不能假手于人。
因为沈友的职务变化，孙策又调整了五州刺史，杜畿继续担任荆州刺史，陶商任徐州刺史，满宠正式接任豫州刺史，伊籍接任青州刺史，高柔接任扬州刺史。
一连数日，孙策都忙得不可开交，不是开会协商，就是接见文武，或是勉励新升官的人，比如伊籍、高柔，或是安抚对职务不太满意的人，比如陶商。还有一些虽然很重要，但一时半会还没办法安排的，他也要接见一下，好让他们安心做事，比如吕岱、孙河。还有询问方略，准备上任的，比如杨修。
虽然还没做皇帝，孙策已经感受到了日理万机的压力，身心疲惫。
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