名义上虽然说是舰队，但是由于在神喻圣痕下的高度精兵化的缘故，实际上不同舰队各自也只有一艘主舰，全舰上下也大概只有数十至半百的人数不等。
而在当中，除了因为能植入神喻圣痕的人以女性为主外，也是因为舰队的提督往往会以自身的性别来决定舰上人员的组成。故此，舰队的组成一般性别偏向都十分严重。
以女性为提督，那就很可能出现全舰都是女性的状况。反之，以男性为提督，则全舰都很可能只有男性。于全国十三队舰队之中，舰上成员以男性为主的舰队，实际上也就只有那么一﹑两队。
十三队舰队各司其职，各有特长，其中又以第一﹑二和十三舰队最为特殊。
第一舰队为皇家舰队，提督即军部元帅若溪宛，同时也是当今军部中号称最强的人物，第一舰队舰上成员都是由全国十三舰队中的中挑选出来的佼佼者，是名副其实的最强舰队。
第二舰队别号盾之舰队，一般守在内海中部，虽然不如皇家舰队一般尽是从各舰中挑选出最厉害的成员，但是舰上的成员基本上都是身经百战之辈，战力一直传闻只在第一舰队之下，除此之外，据闻当今第二舰队提督冯默刃实力更是已迫近军部元帅若溪宛，不过由于两人貌似没有交手的缘故，到底这传闻是真还是假则没有人能知晓了。
第十三舰队则又名技术开发局。虽说在很久以前，技术开发局曾经是一个独立的部门，但是自从发现与神喻水晶相关的科技都得由有神喻圣痕的人才能驾御以来，当时的总统就很果断地把技术开发局并进第十三舰队中了。第十三舰队的成员或许不怎么擅长战斗，但是毫无疑问在那儿的都是全人类的科研精英。当中，又以现任技术开发局局长八意咏琳和前任技术开发局副局长最为著名。基本上如今依赖神喻水晶建立起来的各种绝密科技，比方说以芯片作为媒介实行的点对点传送，以及将神喻水晶能源转化成物质再合成为各类实物等等举世知名的科技，都是在这两人的手中研发出来的。
以上的三队舰队，如无意外的话，一般都会驻守在本土以及内海的位置，充当苏尼维亚共和国最后的防线。至于在这三队舰队以外，于内海的边缘，则由第十一舰队及第十二舰队担任核心，再加上无数人造或天然岛屿上的岗哨组成了一道连绵而细密的防线。
虽说传统的弹药对异型生物的效用甚微，但是毕竟也不是全无作用。考虑到二十四小时防守的缘故，岗哨上一半以上的配备为自动化的机械武装，比方说各类炮台与机关枪等等，余下的那小半，则由人手来负责。配置岗哨上的人虽然不一定是神喻圣痕的持有者，但是反正本来就不是主力，这点也就不重要了。借着全方位无死角的监视系统，岗哨内的人员可以很准确的捕捉到有没有入侵者与否，一旦发现敌人的踪影，便会立即通报在附近海域驻防的两队舰队前来救援...当然，考虑到人为机制有可能会出现人为错误的关系，岗哨里实际上还被加上了只要有武装开火便会通报附近岗哨与舰队又或者只要有武装损毁便会通报附近舰队及本土的皇家舰队这两道保险。
其实，在如今技术开发局的科技下，岗哨里的人手虽然不能说完全无用，但是用途却也甚微，说白一点，实际上这职位也不过是拿来充数的而已。毕竟，就算再怎么精兵化，也不可能说把原有军队的所有普通人裁掉。留在内海的岗哨里协助持有神喻圣痕的主力部队维持防线，这就是在新时代中不具备圣痕的军人仅有的任务之一。
至于姬月华现在被编进的第七舰队―羽之舰队，则是属于外海巡逻队之一的舰队。
全国十三舰队中，扣除作为防线及支持的五队舰队，余下的八队舰队一般会以轮流制休息。以两队舰队为一组，在一般的情况下，六队的舰队会分成三组于外海巡行，每一组彼此之间不能相距太远且需偶尔通信，除了拦截来犯的异型生物之外，同时也担当起收集水晶能源，对不同区域的资源及岛屿